Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cux2P70298 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux2P70298 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cux2P70298 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cux2P70298 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms