Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp3P70281 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms