Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfixP70257 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfixP70257 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfixP70257 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfixP70257 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms