Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf5P70191 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf5P70191 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms