Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SbdsP70122 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms