Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba4aP68368 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms