Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Acta1P68134 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms