Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Crip1P63254 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms