Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms