Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpfP62307 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpfP62307 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms