Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actr1aP61164 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actr1aP61164 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actr1aP61164 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actr1aP61164 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms