Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcbp1P60335 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms