Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exosc10P56960 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exosc10P56960 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms