Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn18P56857 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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