Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Irf5P56477 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms