Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms