Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Aqp4P55088 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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