Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GemP55041 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GemP55041 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GemP55041 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GemP55041 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GemP55041 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GemP55041 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GemP55041 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GemP55041 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GemP55041 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms