Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ephb3P54754 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ephb3P54754 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms