Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad23aP54726 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms