Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb3P54285 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms