Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pms2P54279 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pms2P54279 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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