Protein–RNA interactions for Protein: P53368

Nudt1, 7,8-dihydro-8-oxoguanine triphosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt1P53368 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt1P53368 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt1P53368 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms