Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Map3k1P53349 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map3k1P53349 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms