Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms