Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TubP50586 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TubP50586 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TubP50586 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TubP50586 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms