Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb42P49222 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms