Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc3P49135 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc3P49135 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms