Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms