Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli1P47806 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms