Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms