Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms