Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms