Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms