Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lig1P37913 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms