Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rfc1P35601 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms