Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr2P35343 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms