Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc1P34928 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms