Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms