Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Saa4P31532 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms