Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc10P31257 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms