Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pabpc1P29341 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms