Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif5cP28738 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms