Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja4P28235 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms