Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms