Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms