Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm2P23804 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mdm2P23804 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms