Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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