Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja1P23242 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms