Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Eif3aP23116 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms